本篇目录：

• 1、如何批量将转录组所有基因序列的蛋白找到
• 2、如何寻找关键基因
• 3、如何利用CRISPR来开展全基因组筛选
• 4、如何利用dnastar快速筛选重复序列
• 5、怎样更高效的从ncbi里面筛选基因
• 6、如何快速从转录组数据中筛选目标基因!

如何批量将转录组所有基因序列的蛋白找到

1、区域中包含返回值的列号，也就是找到相关值之后返回第几列的信息；精确匹配或者近似匹配，一般我们选择精确匹配。精确匹配采用0/FALSE、近似匹配采用1/TRUE。

2、寻找要的基因序列就行了。注意的是，要确定基因名称是否是统一的，找到基因序列，蛋白序列就很容易了，因为结果中会显示该基因的蛋白序列。可以在开始search的时候选protein，找到的就是蛋白序列了。

3、基因数据库搜索：使用类似于NCBI（National Center for Biotechnology Information）提供的大型公共数据库，如GenBank或Ensembl等，搜索你感兴趣的基因名称或转录本ID。这些数据库包含许多物种的基因组和转录组数据。

4、NCBI中Gene搜索昆虫的物种，点开对应蛋白的名称，有详细介绍和基因组序列 下拉有“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”这一项 NM开头的是mRNA序列，NP开头的是氨基酸序列，也就是蛋白序列。

如何寻找关键基因

如何需找并证实参与某一器官发育的关键基因 用基因敲除，看能否表达来验证。

打开NCBI 百度搜索键入“NCBI”，点击“搜索”，第一个就是官方主页，点击打开。关键字查找 以H9亚型流感病毒HA基因下载为例，说明详细过程。

而我们这个研究，主要是利用一套新的方法，利用跳跃基因在小鼠胚胎干细胞里面诱发突变。然后，我们再一一筛选，这个突变所造成的一些大脑发育的问题。

文章中同时强调，意大利的黄绿色的葡萄品种突然变异成红色，是受了一种红色色素的合成因子的影响，而即使是同种基因受到阻碍也可能变成另外一种较活跃的因子（LINE），而把这种因子进行排列后引入DNA，就可以使红色变成黄绿色。

..刚好学到 基因工程流程的第一步就是获得目的DNA片段，如何获得目的DNA片段就成为基因工程的关键问题。所需目的基因的来源，不外乎是分离自然存在的基因或人工合成基因。

如何利用CRISPR来开展全基因组筛选

1、CRISPR-Cas9筛选 ：使用阴性筛选，阳性筛选和对照筛选，以文章中使用全基因组gRNA文库筛选使黑色素瘤对细胞毒性T细胞介导的杀伤具有抗性的基因为例。

2、全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年， Renato Dulbecco是最早提出人类基因组定序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列，对於癌症的研究将会很有帮助。

3、表型筛选：将全基因组敲除细胞库分成两份，其中一份作为实验组施加筛选压力，如：病毒侵染，药物治疗等；另一份作为对照组。根据耐药性、增殖能力、存活能力等表型筛选细胞。

4、相比之下，混合文库筛选成本低、操作简单且可用于体内研究，能够更全面地覆盖全基因组，侵染的细胞可在长期培养后检测结果。 CRISPR 文库多使用混合文库形式进行高通量筛选。

5、以CRISPR-Cas9基础的基因编辑技术在一系列基因治疗的应用领域都展现出极大的应用前景，例如血液病、肿瘤和其他遗传疾病。该技术成果已应用于人类细胞、斑马鱼、小鼠以及细菌的基因组精确修饰。

6、功能基因组筛选 利用CRISPR-Cas9进行基因编辑可以产生大量的基因突变细胞，因此利用这些突变细胞可以确认表型的变化是否是由基因或者遗传因素导致的。

如何利用dnastar快速筛选重复序列

可以使用在线分析工具RepeatMasker： http：//，重复序列和CG含量都可以同时分析出来。另外也可以使用DNAstar。

本实验分离株皆属第二群，而且还与其它病症相关。

NCBI上有Blast，你可以把你的序列输进去，blast一下，可以搜到很多相似序列，然后可以把这些序列做同源性分析。

怎样更高效的从ncbi里面筛选基因

胰岛素的英文名你总知道吧？随便翻本字典就有。然后打开NCBI主页，下拉菜单里选gene，然后后面输入胰岛素英文名，点go就行了。

打开NCBI主页 2 左边search里面选择GENE 右边的对话框里输入你想要的基因名称 3 在出来的所有条目第一行后面都有种属表明，比如Homo sapiens是人Felis catus是猫。选择你想要的种属。

进入NCBI的首页先选择你要的是全序列还是EST然后就输入你要的基因名最好是英文的。进行筛选就行了。不动可以再问很简单。

，打开NCBI，选择核苷酸（Nucleotide）数据库，填上Phenylalanine ammonia-lyase，点击GO，搜索 2，我们来看结果，总共有1022 个，结果太多了，有时候刚好你要的结果在第一页的话，那就好办。

在NCBI主页上方search栏左边有一个database选择框，点击下拉三角形选择nucleotide（如图红框）在search栏输入基因名搜索即可。

详细参考ncbi handbook中entriz检索系统。支持布尔运算符。你需要：首先了解ncbi里有哪些大的数据库，什么是布尔运算符。基因名称，物种拉丁文，目的片段长度阈值等，根据它来检索即可。

如何快速从转录组数据中筛选目标基因!

atcg碱基随机排列，各碱基比例均衡，cg含量40至60%，不连续出现四个及以上c或g，末端为c或g，长度18至23，按照2乘以at数目加上4乘以cg数目，算下来，60或62。八成能p出特异性条带。

扩大基因集：只关注特定的基因，而韦恩图中没有显示出来，可以考虑扩大基因集。检查转录组数据中的其他基因列表或数据库，以确保没有漏掉感兴趣的基因。可以使用基因注释数据库或转录组数据库来获取更全面的基因列表。

利用转录组数据寻找生物标志物的方法为：打开转录组数据。利用回放方式找出转录组数据中差异数据。对差异数据进行比对，通过比对找出生物标志物数据。

从基因文库中筛选某一克隆的常用办法是分子杂交。首先把属于一个文库的细菌或噬菌体以较低密度接种在培养皿上以取得相当分散的菌落或噬菌斑，然后用硝酸纤维滤膜吸印，使培养皿和滤膜的相对应的位置上具有相同的克隆。

问题二：关键基因相关数据整合（整合不同表格中的数据）解决方案 ：Vlookup函数 VLOOKUP是一个查找函数，给定一个查找的目标，它就能从指定的查找区域中查找返回想要查找到的值。

(四)用逆转录酶制备cDNA 大多数的目的基因是由mRNA合成cDNA(反转录DNA)得到。

到此，以上就是小编对于抗性基因筛选的原理的问题就介绍到这了，希望介绍的几点解答对大家有用，有任何问题和不懂的，欢迎各位老师在评论区讨论，给我留言。